Palais de la découverte blev designet af Jean Perrin i 1934 og blev oprettet i 1937 for at vise offentligheden "videnskaben i sin vorden". Ideen var at "tage videnskaben ud af laboratorierne" og involvere offentligheden i fødslen af videnskabelige opdagelser, den vigtigste kilde til fremskridt. Selvom det var meningen, at det skulle være kortvarigt og lukke efter udstillingen i 1937, overbeviste dets succes regeringen om at gøre det permanent med dekretet af 8. april 1938, som knyttede det til Caisse nationale des sciences. Den 9. januar 1940 blev det ved endnu et dekret knyttet til universitetet i Paris. I 1970'erne mistede det gradvist sin højtidelige karakter. I 1972 blev Palais de la Découverte ved dekret nr. 72-367 af 28. april omdannet til en selvstændig offentlig institution. I 1990 fik det status som grand établissement ved dekret nr. 90-99 af 25. januar, som stadig er i kraft.