I august 1348 blev Paris ramt af en frygtelig sygdom, som hverken skånede kvinder, børn, adelige eller fattige. I løbet af fire år ville epidemien Den Sorte Død decimere en tredjedel af Paris' befolkning.
Den 24. august 1572 blev 4.000 huguenotter brutalt myrdet i Paris under massakren på Bartholomæusdagen, kulminationen på religionskrigene mellem katolikker og protestanter.